{"id":2661,"date":"2025-06-11T17:45:23","date_gmt":"2025-06-11T15:45:23","guid":{"rendered":"https:\/\/www.linkidoc.fr\/blog\/2025\/06\/11\/le-hpc-base-sur-le-cloud-aide-les-chercheurs-a-faire-avancer-les-soins-de-sante\/"},"modified":"2025-06-11T17:45:28","modified_gmt":"2025-06-11T15:45:28","slug":"le-hpc-base-sur-le-cloud-aide-les-chercheurs-a-faire-avancer-les-soins-de-sante","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.linkidoc.fr\/blog\/2025\/06\/11\/le-hpc-base-sur-le-cloud-aide-les-chercheurs-a-faire-avancer-les-soins-de-sante\/","title":{"rendered":"Le HPC bas\u00e9 sur le cloud aide les chercheurs \u00e0 faire avancer les soins de sant\u00e9"},"content":{"rendered":"
\n

AWS fournit des ressources HPC \u00e0 la demande pour les chercheurs en sant\u00e9<\/h2>\n

Bien qu'il y ait des avantages pour les clusters sur site, la mise en place d'un cluster HPC traditionnel peut prendre jusqu'\u00e0 sept ou huit mois. Au moment o\u00f9 une organisation se procure le mat\u00e9riel n\u00e9cessaire et la d\u00e9finit, la technologie pourrait d\u00e9j\u00e0 \u00eatre obsol\u00e8te. Sans oublier que les unit\u00e9s de traitement graphique n\u00e9cessaires peuvent \u00eatre difficiles \u00e0 se procurer. L'utilisation des services HPC via AWS garantit que l'organisation a imm\u00e9diatement acc\u00e8s au plus r\u00e9cent mat\u00e9riel, selon Xu.<\/p>\n

AWS offre aux organisations de soins de sant\u00e9 plusieurs options en ce qui concerne le HPC. AWS Parallel Computing Service est un cluster Utilitaire Linux simple enti\u00e8rement g\u00e9r\u00e9 pour la gestion des ressources. Un chercheur peut cr\u00e9er un cluster Slurm qui r\u00e9pond \u00e0 ses sp\u00e9cifications, telles que les types de processeurs et les besoins de latence, dans les 20 minutes. L'utilisateur peut contr\u00f4ler les n\u0153uds de calcul et construire les groupes de n\u0153uds eux-m\u00eames. De plus, un utilisateur peut ex\u00e9cuter une application native ou ex\u00e9cuter des applications conteneuris\u00e9es sur AWS avec le planificateur Slurm.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Vous pouvez cr\u00e9er un environnement de calcul qui peut atteindre 100 000 processeurs, mais si vous ne demandez que deux processeurs, c'est combien vous serez factur\u00e9\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 Xu. \u00abC'est \u00e0 la demande. Vous payez ce que vous utilisez.\u00bb<\/p>\n

AWS ParallelCluster est un service alternatif pour les chercheurs qui souhaitent un contr\u00f4le total du planificateur Slurm et de ses plug-ins. Il s'agit d'une solution open source qui permet \u00e0 l'utilisateur de cr\u00e9er un cluster HPC enti\u00e8rement personnalis\u00e9 dans le cloud qu'il g\u00e8re lui-m\u00eame.<\/p>\n

Les chercheurs peuvent choisir parmi plus de 800 types d'instances HPC. Des ressources telles qu'Amazon FSX pour Luster et Amazon File Cache sont d'autres ressources disponibles pour aider avec les objectifs HPC.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Nous ne voulons pas que vous gaspiez des ressources, donc vous ne payez que pour ce que vous utilisez\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 Xu.<\/p>\n<\/p>\n

Le NIH utilise le HPC pour mieux comprendre les prot\u00e9ines des maladies cardiovasculaires<\/h2>\n

La maladie cardiovasculaire est la cause n \u00b0 1 de la mortalit\u00e9 humaine dans le monde. En 2019, 18,6 millions de personnes sont mortes de la maladie dans le monde. Le fait d'avoir une grande quantit\u00e9 de lipoprot\u00e9ines de faible densit\u00e9 dans le sang augmente le risque de maladie cardiovasculaire. Les particules LDL peuvent s'accumuler dans le sang, se d\u00e9poser sur les murs des art\u00e8res et former des plaques, ce qui pourrait entra\u00eener une crise cardiaque ou un accident vasculaire c\u00e9r\u00e9bral.<\/p>\n

Aux \u00c9tats-Unis, 30% \u00e0 40% de la population de plus de 50 ans demande des statines pour traiter le cholest\u00e9rol \u00e9lev\u00e9, selon Marcotrigiano. Les statines fonctionnent en ciblant le r\u00e9cepteur, pas la particule elle-m\u00eame. Pour en savoir plus sur la particule, les scientifiques du NIH ont r\u00e9cemment utilis\u00e9 le HPC et la microscopie cryo-\u00e9lectron pour mod\u00e9liser les particules LDL, un processus que les gens consid\u00e9raient autrefois impossible, a d\u00e9clar\u00e9 Marcotrigiano.<\/p>\n

La mod\u00e9lisation des particules elles-m\u00eames n\u00e9cessitait d'\u00e9normes quantit\u00e9s de donn\u00e9es. Un ensemble de donn\u00e9es comprenait 35 000 films et environ 17,5 t\u00e9raoctets de donn\u00e9es. Les films devaient \u00e9galement \u00eatre compress\u00e9s en images haute r\u00e9solution. Les chercheurs ont align\u00e9 des particules sur la base de similitudes et de diff\u00e9rences, classant les particules d'un \u00e9chantillon utilisant des syst\u00e8mes 2D et 3D.<\/p>\n

En cons\u00e9quence, les chercheurs ont une meilleure compr\u00e9hension de la fa\u00e7on dont la particule se lie aux r\u00e9cepteurs, ce qui sera utile pour d\u00e9velopper de nouvelles th\u00e9rapies qui ciblent la particule elle-m\u00eame plut\u00f4t que les r\u00e9cepteurs.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Le seul endroit o\u00f9 nous pouvions le faire \u00e9tait dans le cloud\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 Marcotrigiano, ajoutant que le NIH a utilis\u00e9 Amazon FSX pour Luster et plusieurs GPU pour traiter et stocker les donn\u00e9es de ce projet.<\/p>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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